哈佛大学在诉讼中表示：“（特朗普）政府一挥笔，就试图抹去哈佛大学四分之一的学生，这些国际学生为本校及其使命作出了重大贡献”。哈佛大学补充道：“这是政府对哈佛大学行使（宪法）第一修正案赋予的权利，拒绝政府控制哈佛大学治理、课程设置以及师生‘意识形态’的要求而采取的最新明显报复行动”。

在长达72页的诉讼中，哈佛大学指控美国国土安全部在毕业前几天实施了一项“史无前例的报复性”行为，威胁着数千名学生的命运。目前，超过7000名学生持签证在哈佛大学学习。

哈佛大学校长加伯（Alan Garber）在致附属机构的周五晨间信息中写道，撤销签证的行为“既不合法，也毫无根据”。他补充道：“这危及哈佛大学数千名学生和学者的未来，也对全国各地高校无数来到美国求学、实现梦想的人们敲响了警钟”。

就在不到24小时前，美国国土安全部通知哈佛大学，由于校园反犹太主义和种族歧视等指控，该校不再获得“学生和交流访问者计划”（SEVP）的认证——该校70多年来一直保持着这一认证。如果失去SEVP资格，现有和未来的国际学生将需要转学到其他大学，否则将失去在美国合法居留的权利。

哈佛大学在法庭文件中称，此次撤销该校的认证是出于政治动机的报复行为，其实施“未经程序或理由”，是旨在迫使哈佛大学对其招生、招聘和学术项目施加意识形态的测试。

哈佛大学辩称，撤销其SEVP资格也违反了美国宪法《第一修正案》，侵犯了该校的学术自由，并报复哈佛大学发表受宪法保护的言论。周五上午的诉讼是哈佛大学第二次对特朗普政府发起法律挑战，此前，该校曾就削减数十亿美元研究经费一事起诉白宫。在一位联邦法官同意加快审理程序后，第一起诉讼的听证日期定于7月21日，但超过27亿美元的联邦资金仍被冻结。

美国国土安全部部长诺姆（Kristi Noem）周四下令终止哈佛大学的SEVP认证。美国国土安全部称：“哈佛大学领导层纵容反美、支持恐怖主义的煽动者骚扰和殴打个人，包括许多犹太学生，并以其他方式妨碍其曾经令人尊敬的学习环境，从而营造了一个不安全的校园环境。这些煽动者中有许多是外国学生。哈佛大学领导层进一步协助并参与了与中共的协调活动，包括接待和培训参与维吾尔族种族灭绝的中共准军事组织成员”。

诺姆表示：“本届政府要求哈佛大学承担在校园内煽动暴力、反犹太主义以及与中国共产党协作的责任”。根据哈佛大学的数据，本学年招收了近6800名国际学生，占总招生人数的27%。哈佛大学表示，撤销认证将迫使其取消数千名国际学生的入学资格，并使“无数”学术项目、诊所、课程和研究实验室在毕业典礼前几天陷入混乱。这所拥有389年历史的大学表示：“没有国际学生，哈佛就不是哈佛”。